Банк России образует единую централизованную систему с вертикальной структурой. В эту систему входят: центральный аппарат, территориальные учреждения, расчетно-кассовые центры, вычислительные центры, полевые учреждения, учебные заведения и другие предприятия и организации, необходимые для осуществления деятельности Банка России.
В организационном плане структуру центрального аппарата Банка России представляют 25 департаментов и 2 управления, которые в совокупности осуществляют реализацию возложенных на Банк России функций. Например, департамент лицензирования кредитных организаций и аудиторских фирм является структурным подразделением Банка России. На это подразделение возложено выполнение функций государственной регистрации кредитных организаций, выдачи лицензий банкам и организациям, занимающимся банковским аудитом.

Высшим органом ЦБ РФ является совет директоров, который определяет основные направления его деятельности и осуществляет руководство и управление Банком России. В совет директоров входят Председатель Банка России и 12 членов, которые работают на постоянной основе. Председатель ЦБ РФ назначается Государственной Думой на 4 года. Кандидатура Председателя представляется дляутверждения Президентом РФ. Государственная Дума РФ также рассматривает вопрос об освобождении Председателя Банка России. В случае отклонения предложенной кандидатуры Президент стра-, ны в течение двух недель вносит на рассмотрение Государственной Думы новую кандидатуру.
Занимать должность Председателя одному и тому же лицу разрешается не более трех сроков подряд. Члены совета директоров назначаются на должность сроком на 4 года Государственной Думой по представлению Председателя Банка России. По закону заседания совета директоров должны проходить не реже одного раза в месяц.

В целях совершенствования денежно-кредитной системы при Банке России создан Национальный банковский совет численностью 15 человек. Он изучает новые концепции совершенствования банковской системы РФ, проекты основных направлений единой государственной денежно-кредитной и валютной политики, вопросы регулирования деятельности кредитных организаций, участвует в разработке основных принципов организации системы расчетов в стране.

Территориальные подразделения ЦБ РФ представлены территориальными учреждениями и расчетно-кассовыми центрами (РКЦ). От успешной работы территориальных подразделений во многом зависит эффективность выполнения возложенных на Банк России функций.